三色猫的毛色是由遗传学上称为性连锁基因所决定的，这些基因位于X染色体上。由于雄性猫具有XY染色体，而雌性猫具有XX染色体，这就导致了三色猫性别分布的不均。
在三色猫的情况下，黑色和橘色的基因是性连锁的，这意味着它们位于X染色体上。而白色基因位于常染色体上，与性别无关。因此，一个猫要表现出三色（黑白橘）的毛色，它需要有以下基因组合：
- 从母亲那里继承的X染色体带有黑色或橘色基因。
- 从父亲那里继承的X染色体（如果雌性）或Y染色体（如果雄性）没有这些颜色基因的显性版本。
对于雌性猫来说，要表现为三色，她可以从父母双方继承不同的颜色基因，因为她们有两条X染色体。但对于雄性猫来说，由于只有一条X染色体，这就使得表现出三色的可能性大大降低。
以下是为什么三色雄性猫较为罕见的具体原因：
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遗传限制：雄性猫只有一条X染色体，这意味着它们只能从母亲那里继承一个颜色基因（黑色或橘色）。如果它们继承的是黑色或橘色的显性基因，那么就不会有第三种颜色（白色）的表现，因为这两种颜色基因会覆盖白色基因的表达。
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遗传变异：在极少数情况下，雄性猫可能由于遗传变异（如基因去活性化）而表现出第三种颜色，但这通常与较低的生殖能力相关联。
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生殖能力：由于这些遗传变异可能与生殖细胞的功能受损有关，这些雄性三色猫通常具有较低的生殖能力，甚至可能是不育的。
因此，由于这些遗传和生理因素，三色雄性猫在自然界中非常罕见，而三色猫大多数为雌性。这也解释了为什么在宠物收养或繁殖中，三色雄性猫并不常见。