在宠物仓鼠的养殖过程中，确实需要将怀孕的母仓鼠与公仓鼠分开饲养。以下详细解释这样做的原因：
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减少母鼠压力：母仓鼠在怀孕期间生理和心理都处于高度紧张状态，公鼠的存在可能会使母鼠感到不安，增加其心理压力，容易导致流产。
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避免繁殖伤害：母仓鼠生产后，如果公鼠仍在同一环境中，可能会出现攻击小仓鼠的情况。此外，如果公仓鼠处于发情期，可能会继续尝试与母鼠交配，这会对母鼠造成身体伤害，由于仓鼠每次繁殖都会消耗大量体力，连续繁殖可能危及母鼠的生命。
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确保小仓鼠安全：刚出生的小仓鼠非常脆弱，公仓鼠可能会将它们视为入侵者或食物而进行攻击。同时，如果母鼠感到外界威胁，出于保护本能，她可能会攻击或吃掉自己的幼崽。
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遵循独居天性：仓鼠是典型的独居动物，除了交配期外，它们并不适应与其他仓鼠共同生活。分开饲养符合它们的自然习性。
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气味识别问题：仓鼠通过气味来辨认同类，长时间隔离可能导致双方忘记对方气味，再次同笼可能会产生冲突。
具体实施建议：
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隔离时间：一旦确定母仓鼠怀孕，就应该立即将公鼠和母鼠分开。如果不确定怀孕时间，也应在观察到母鼠怀孕迹象（如乳头变红、腹部增大等）后立即隔离。
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隔离环境：为母仓鼠提供一个安静、舒适的环境，尽量避免干扰和压力，保证其有足够的空间休息和活动。
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注意产后：小仓鼠出生后，母鼠的攻击性可能会增强，因此产后更需要注意隔离，直到小仓鼠可以独立生活。
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重新适应：如果考虑将来将公鼠和母鼠重新配对，需要逐渐让它们适应对方的气味，避免直接合笼可能产生的冲突。
综上所述，分房饲养是为了确保母仓鼠和其幼崽的安全，以及遵循仓鼠的独居天性，是必要的养殖管理措施。